中药学论文_基于网络药理学和分子对接法的益智

文章摘要:目的：运用网络药理学及分子对接方法探讨益智清心方（YZQXF）对阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease，AD）的作用靶点，构建活性成分-靶点-通路网络并分析其作用信号通路，探讨其对AD的防治作用及可能的分子机制。方法：根据YZQXF药味组成，在中药系统药理学数据库及分析平台（TCMSP）检索各药材的有效化学成分及各成分相应的作用靶点；利用GeneCard、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库搜索AD相关靶点，同时将药物靶点及疾病靶点数据进行比对获得交集靶点，上传STRING11.5数据库对其进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析并找到核心靶点；通过Cytoscape3.7.1构建YZQXF治疗AD的活性成分-作用靶点-通路网络；借助BioConductor软件的R语言包对作用靶点进行基因本体（GO）注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析；最后将核心基因分别与关键靶标进行分子对接，验证YZQXF关键成分与核心靶点的作用特征。结果：YZQXF中共有43个化学成分作用于2871个AD相关靶点，共存在129个化学成分-靶点相互作用关系。YZQXF治疗AD的关键成分包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、四氢小檗碱、豆甾醇、原阿片碱、杨梅酮、小檗浸碱、巴马汀、马卡因、小檗碱，核心靶点为丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、MYC原癌基因（MYC）、Fos原癌基因（FOS）、MAPK14、Jun原癌基因（JUN）、RELA基因、蛋白激酶B1（Akt1）、MAPK8、白细胞介素-1β（IL-1B）、肿瘤蛋白p53（TP53）。GO富集得到2359个生物过程条目，主要涉及对脂多糖的反应、对细菌来源的分子反应等生物过程，膜筏、膜微域等细胞组分以及G蛋白偶联受体活性、神经递质受体活性等分子功能。KEGG通路富集得到168个通路，主要包括流体剪切应力与动脉粥样硬化（Fluid shear stress and atherosclerosis）、糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路（AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications）等。分子对接结果显示，YZQXF中的关键活性成分与治疗AD的核心靶点有较好的结合性。结论：YZQXF可通过多种活性成分、多个关键靶点及多种作用途径治疗AD。

文章关键词:

论文DOI:10.13313/j.issn.1673-4890.20210118008

论文分类号:R285

文章来源：《中国药理学与毒理学杂志》 网址: http://www.zgylxydlxzz.cn/qikandaodu/2022/0114/899.html