中药学论文_基于网络药理学与生物信息学探讨《

文章摘要:目的采用网络药理学和生物信息学方法探讨《古今录验》续命汤治疗急性脑梗死的作用机制，为其临床治疗提供思路。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、中医药整合药理学研究平台（TCMIP）、PubChem、Chemspider、SwissTargetPrediction、GEO、miRDB、miRTarBasead、TargetScan数据库获取和挖掘《古今录验》续命汤的活性成分、预测靶点及急性脑梗死的差异表达长链非编码RNA（lncRNA）、微小RNA（miRNA）、信使RNA（mRNA），利用R软件ggalluvial包绘制竞争性内源RNA（ceRNA）网络。将得到的差异miRNA采用TransmiRv2.0数据库预测转录因子，采用ggplot2包对转录因子与中药靶点取交集。使用Cytoscape3.8.0软件及其插件Cytohubba与STRING数据库构建活性成分-关键转录因子网络、蛋白相互作用网络，并进行核心基因筛选。运用R语言Biomanager、ClusterProfiler包进行关键转录因子GO功能及KEGG通路富集分析，最后予以分子对接评估。结果收集并筛选出《古今录验》续命汤57个活性成分，潜在作用靶点816个，急性脑梗死差异lncRNA 48个，构建了由16个关键lncRNAs、16个关键miRNAs和17个关键mRNAs组成的ceRNA转录网络。采用TransmiR v2.0数据库预测出294个转录因子，与方剂活性成分作用靶点取交集，取得关键转录因子43个。富集分析结果显示，这些靶基因参与了急性脑梗死的自噬、氧化应激、炎症反应、凋亡等病理生理过程，主要通过IL-17信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路发挥作用。结论 《古今录验》续命汤可能通过调控IL-17信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路等，靶向调控急性脑梗死的自噬、氧化应激、炎症反应、凋亡等病理过程。

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项目基金:《中国药理学与毒理学杂志》 网址: http://www.zgylxydlxzz.cn/qikandaodu/2021/1130/831.html