中药学论文_基于GEO数据库差异基因贞芪扶正颗

文章目录

1 资料与方法

1.1 肝癌差异基因筛选

1.2 贞芪扶正颗粒有效成分与靶点筛选

1.3 贞芪扶正颗粒治疗肝癌靶点筛选与作用网络构建

1.4 GO(Gene ontology）富集分析与KEGG信号通路分析

2 研究结果

2.1 肝癌差异基因

2.2 贞芪扶正颗粒成分和潜在靶点

2.3 贞芪扶正颗粒治疗肝癌作用靶点

2.4 GO功能富集分析

2.5 KEGG信号通路富集分析

3 讨论

文章摘要:目的:基于GEO数据库和网络药理学探索贞芪扶正颗粒治疗肝癌的作用机制。方法:从GEO数据库中获取肝癌组织及癌旁正常组织差异基因,从中药系统药理学分析平台（TCMSP）中获取贞芪扶正颗粒的有效化合物及其作用靶点。构建有效化合物-靶点网络,利用STRING数据库构建蛋白互作（PPI）网络,使用R软件进行GO富集和KEGG通路富集分析,并使用Cytoscape 3.8.0软件构建靶点-信号通路网络图。结果:与癌旁正常组织比较,肝癌组织中高表达的前3位基因分别是GPC3、SPINK1和AKR1B10。从TCMSP数据库中收录黄芪有效成分87个,女贞子有效成分119个。网络拓扑学分析发现中心值和度值排名前3位化合物分别是槲皮素、山柰酚和木犀草素。度值排名前3位潜在靶点基因分别是CYP1A1、CYP3A4和CYP1A2。GO富集共获得生物学过程条目273个,生物学过程主要富集于生物对外来刺激的反应,对金属离子的反应和细胞激素代谢过程。KEGG通路主要富集于细胞色素P450的异生素代谢,化学致癌作用和药物代谢-细胞色素。结论:贞芪扶正颗粒可通过多分子、多靶点、多通路影响化疗药物的生物转化、代谢清除和提高对纳米治疗的敏感度,达到辅助治疗肝癌的目的。

文章关键词:

论文作者:张金发 杭小凤 李方正 刘伟强 

论文DOI:10.13457/j.cnki.jncm.2021.21.037

论文分类号:R285

文章来源：《中国药理学与毒理学杂志》 网址: http://www.zgylxydlxzz.cn/qikandaodu/2021/1111/800.html